Сюжет этой истории разворачивается в фантастической вселенной. Отличительной особенностью этого мира является то, что он погружается под воду из-за глобального потепления. И вот однажды появляется особо опасный противник под названием «Туманный флот». Опасность этого противника заключается в том, что их корабли вооружены самым мощным оружием. Люди пренебрегли этим противником, о чем быстро пожалели. Вражеская армада напала на ничего не подозревающих граждан, застигнув их врасплох. Никто не догадывался о такой мощной силе нападавших.
Когда «Туманный флот» напал, ни одна армия людей не смогла противостоять ему, и они понесли огромные потери без успешной контратаки. Лишь небольшим группам людей удалось выбраться живыми. Через семнадцать лет одному из выживших удалось захватить одну из вражеских подводных лодок и переименовать ее в I-401, то же название, что и у последнего человеческого корабля. К несчастью для выживших, в захваченной субмарине находилось таинственное существо, представляющее для них большую угрозу. Теперь главный герой и его команда должны сражаться с противниками и пытаться остаться в живых в сложной и опасной обстановке.